苗床育苗营养土的营养元素可以像大田育苗一样随时追补，因此，对营养土的要求没有容器育苗那么苛刻，营养土基料来源广泛；育苗设施也相对简单些。因而可大大降低成本，一般相当于育苗穴盘育苗成本的50%以下。
苗木整体质量高于育苗盘苗。接穗纯度、砧木纯度，无病毒感染，无根结线虫等，能够达到与容器苗相似的水平。地上部生长也能与容器苗媲美。根系生长发育比育苗盘苗更好，容器苗细根极多，且相互盘绕，粗根生长发育欠佳，而苗床育苗不仅细根很发达，粗的骨干根也发育良好。因此，带土定植，任何季节都像容器苗一样，成活率达100%。裸根打捆长途调运，冬春季定植，成活率也能达到100%。定植后1-2年，生长比容器苗快得多，最少提前一年投产。
苗床苗的整齐度略逊于容器苗，因为育苗穴盘器育苗是一株一钵，在育苗过程中，可根据砧木生长的状况、嫁接后，接芽萌发的迟早及嫁接苗生长的状况等，随时移动，分级培养，能较好地避免因竞争造成的苗木高矮大小不一的问题，达到高度整齐一致。